4월 10일. 새 학기 첫 등교일.귀여운 여동생이 깨워준 덕분에 잠에서 깨어난 이츠카 시도는오늘도 평소와 다름없는 일상을 보내게 될 것이라고 믿어 의심치 않았다.정령이라고 불리는 소녀와 만날 때까지는······.아무런 예고 없이 날아온 충격파 때문에 흔적도 없이사라진 마을. 크레이터로 변한 마을 한 가운데에 서있는 소녀는 말했다.「······너도, 날 죽이러 온 거지?」세계를 죽이는 재앙이자 정체불명의 괴물이라 불리며세계에게 부정당한 소녀를 막을 방법은 두 가지. 섬멸, 혹은 대화.군복을 입은 여동생…